John Abrams - Coronavirus (Den usynlige morder)

I slutningen af maj 2003, undersøgelser fra prøver af vilde dyr, der sælges som fødevarer på det lokale marked i Guangdong, Kina, fandt en stamme af SARS coronavirus kunne isoleres fra maskerede palme civets (Paguma sp.), men dyrene ikke altid vise kliniske tegn. Den foreløbige konklusion var SARS-virus krydsede xenografiske barriere fra palme civet til mennesker, og mere end 10.000 maskerede palme civets blev dræbt i Guangdong-provinsen. Virussen blev også senere fundet i vaskebjørn hunde (Nyctereuteus sp.), ilder grævlinger (Melogale spp.), og indenlandske katte. I 2005, to undersøgelser identificeret en række SARS-lignende coronaviruses i kinesiske flagermus. Fylogenetisk analyse af disse vira viste en høj sandsynlighed for, at SARS coronavirus stammede fra flagermus og spredte sig til mennesker enten direkte eller gennem dyr, der holdes på kinesiske markeder. Flagermusene viste ingen synlige tegn på sygdom, men er de sandsynlige naturlige reservoirer af SARS-lignende coronaviruses. I slutningen af 2006 etablerede forskere fra det kinesiske center for sygdomskontrol og forebyggelse af Hong Kong University og Guangzhou Center for Disease Control and Prevention en genetisk forbindelse mellem SARS coronavirus, der optræder i civets og mennesker, hvilket bekræfter påstande om, at virussen var sprunget over arter.

vIROLOGY

S

––––––––

ARS-CORONAVIRUS FØLGER replikation strategi typisk for coronavirus underfamilie. Den primære humane receptor af virus er angiotensin-konvertere enzym 2 (ACE2), først identificeret i 2003.

––––––––

SCANNING ELECTRON MICROGRAPH af SARS virions

Anden del

Svær akut luftvejssyndrom Coronavirus 2

Svær akut respiratorisk syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2), daglig dag kendt som coronavirus og tidligere kendt under det foreløbige navn 2019 nye coronavirus (2019-nCoV), eren positiv sans enstrenget RNA-virus. Det forårsager coronavirus sygdom 2019 (COVID-19), en luftvejssygdom. SARS-CoV-2 er smitsom hos mennesker, og Verdenssundhedsorganisationen (WHO) har udpeget den igangværende pandemi af COVID-19 en folkesundhedskrise af international bekymring. Stammen blev først opdaget i Wuhan, Kina, så det er undertiden benævnt "Wuhan virus" eller "Wuhan coronavirus". Fordi WHO fraråder brugen af navne baseret på stederog for at undgå forveksling med sygdommen SARS, det undertiden refererer til SARS-CoV-2 som "COVID-19 virus" i den offentlige sundhed kommunikation. Den brede offentlighed ofte kalder både SARS-CoV-2 og den sygdom, det forårsager "coronavirus", men forskerne typisk bruger mere præcis terminologi.

vIROLOGY

H

Infektion

––––––––

UMAN-TIL-HUMAN overførsel af SARS-CoV-2 er blevet bekræftet under coronaviruspandemien for 2019-20. Transmission sker primært via respiratoriske dråber fra hoste og nys inden for en rækkevidde på ca. 1,8 meter. Indirekte kontakt via forurenede overflader er en anden mulig årsag til infektion. Indledende forskning viser, at virus kan forblive levedygtig på plast og stål i op til tre dage, men ikke overlever på pap i mere end en dag eller på kobber i mere end fire timer; virussen er inaktiveret af sæbe, som destabiliserer sin lipid tolags. destabilises [32]Viral RNA er også blevet fundet i afføringsprøver fra smittede mennesker.

I hvor høj grad virussen er smitsom i inkubationstiden, er usikker, men forskning har vist, at svælget når peak viral belastning cirka fire dage efter infektion. februar 2020 anførte Verdenssundhedsorganisationen (WHO), at "overførsel fra asymptomatiske tilfælde sandsynligvis ikke er en væsentlig drivkraft for transmission". Men en epidemiologisk model i begyndelsen af udbruddet i Kina foreslog, at "præsymptomatisk udgydelse kan være typisk blandt dokumenterede infektioner", og at subkliniske infektioner kan have været kilden til et flertal af infektioner.

Taksonomisk, SARS-CoV-2 er en stamme af svær akut respiratorisk syndrom-relaterede coronavirus (SARSr-CoV). Det menes at have zoonotisk oprindelse og har tæt genetisk lighed med bat coronaviruses, hvilket tyder på detfremgik af en flagermus-bårne virus. [En mellemliggende dyr reservoir såsom en pangolin menes også at være involveret i dens indførelse til mennesker. Virussen viser lidt genetisk mangfoldighed, hvilket indikerer, at spillover-hændelsen, der introducerer SARS-CoV-2 til mennesker, sandsynligvis vil have fundet sted i slutningen af 2019.

Epidemiologiske undersøgelser anslår hver infektion resulterer i 1,4 til 3,9 nye, når ingen medlemmer af samfundet er immune og ingen forebyggende foranstaltninger. Virussen spredes primært mellem mennesker gennem tæt kontakt og via respiratoriske dråber fremstillet af hoste eller nys. Det kommer hovedsageligt ind i humane celler ved at binde sig til receptoren angiotensin konvertere enzym 2 (ACE2).

Reservoir

––––––––

DE FØRSTE KENDTE INFEKTIONER fra SARS-CoV-2 stamme blev opdaget i Wuhan, China.The oprindelige kilde til viral transmission til mennesker er fortsat uklart, som gør, om stammen blev patogene før eller efter spillover begivenhed. Fordi mange af de første personer, der blev fundet at være smittet med virus var arbejdstagere på Huanan Seafood Market,erdet blevet foreslået, at stammen kunne stamme fra markedet. Men,anden forskning viser, at besøgende kan have indført virus på markedet, som derefter lettet hurtig udvidelse af infektioner.

Forskning i den naturlige reservoir af virus stamme, der forårsagede 2002-2004 SARS udbruddet har resulteret i opdagelsen af mange SARS-lignende bat coronaviruses, mest med oprindelse i Rhinolophus slægten af hestesko flagermus, og tovirale nukleinsyre sekvenser fundet i prøver taget fra Rhinolophus sinicus viser en lighed på 80% til SARS-CoV-2.En tredje viral nukleinsyre sekvens fra Rhinolophus affinis, indsamleti Yunnan provinsen og udpeget RaTG13, har en 96% lighed med SARS-CoV-2.Bats betragtes som den mest sandsynlige naturlige reservoir af SARS-CoV-2, men forskellene mellem bat coronavirus og SARS-CoV-2 tyder på, at mennesker blev smittet via en mellemliggende vært.

En metagenomisk undersøgelse offentliggjort i 2019 tidligere afsløret, at SARS-CoV, stammen af virus, der forårsager SARS, var den mest udbredte coronavirus blandt en prøve af Sunda pangolins. februar2020 blev det annonceret, at forskere fra Guangzhou havde opdaget en pangolinprøve med en viral nukleinsyresekvens "99% identisk" med SARS-CoV-2. [51]Når de frigives, resultaterne præciseret, at "receptor-bindende domæne af S-protein af den nyopdagede Pangolin-CoV er næsten identisk med 2019-nCoV, med en aminosyre forskel." [52]Pangogolitter er beskyttet i henhold til kinesisk lovgivning, men deres krybskytteri og handel til brug i traditionel kinesisk medicin er stadig almindelig. [53][54]

Mikrobiologer og genetikere i Texas har uafhængigt fundet tegn på reassortment i coronaviruses tyder inddragelse af pangolitter i oprindelsen af SARS-CoV-2. [55]Pangolin coronaviruses, der hidtil kun har fundet 92% af hele deres genomer med SARS-CoV-2, hvilket gør dem mindre ens end RaTG13 til SARS-CoV-2. [56]Dette er utilstrækkeligt til at bevise, at pangogoiner er den mellemliggende vært; til sammenligning delte SARS-virus, der var ansvarlig for udbruddet i 2002-2004, 99,8 % af genomet med en kendt civet coronavirus.

HESTESKO FLAGERMUS er blandt de mest sandsynlige naturlige reservoirer af SARS-CoV-2

Fylogenetik og taksonomi