Bioinformatics

Здесь есть возможность читать онлайн «Bioinformatics» — ознакомительный отрывок электронной книги совершенно бесплатно, а после прочтения отрывка купить полную версию. В некоторых случаях можно слушать аудио, скачать через торрент в формате fb2 и присутствует краткое содержание. Жанр: unrecognised, на английском языке. Описание произведения, (предисловие) а так же отзывы посетителей доступны на портале библиотеки ЛибКат.

Bioinformatics: краткое содержание, описание и аннотация

Предлагаем к чтению аннотацию, описание, краткое содержание или предисловие (зависит от того, что написал сам автор книги «Bioinformatics»). Если вы не нашли необходимую информацию о книге — напишите в комментариях, мы постараемся отыскать её.

Praise for the third edition of
“This book is a gem to read and use in practice.”
— "This volume has a distinctive, special value as it offers an unrivalled level of details and unique expert insights from the leading computational biologists, including the very creators of popular bioinformatics tools."
— “A valuable survey of this fascinating field. . . I found it to be the most useful book on bioinformatics that I have seen and recommend it very highly.”
— “This should be on the bookshelf of every molecular biologist.”
— The field of bioinformatics is advancing at a remarkable rate. With the development of new analytical techniques that make use of the latest advances in machine learning and data science, today’s biologists are gaining fantastic new insights into the natural world’s most complex systems. These rapidly progressing innovations can, however, be difficult to keep pace with.
The expanded fourth edition of the best-selling
aims to remedy this by providing students and professionals alike with a comprehensive survey of the current field. Revised to reflect recent advances in computational biology, it offers practical instruction on the gathering, analysis, and interpretation of data, as well as explanations of the most powerful algorithms presently used for biological discovery.
offers the most readable, up-to-date, and thorough introduction to the field for biologists at all levels, covering both key concepts that have stood the test of time and the new and important developments driving this fast-moving discipline forwards.
This new edition features: 
New chapters on metabolomics, population genetics, metagenomics and microbial community analysis, and translational bioinformatics A thorough treatment of statistical methods as applied to biological data Special topic boxes and appendices highlighting experimental strategies and advanced concepts Annotated reference lists, comprehensive lists of relevant web resources, and an extensive glossary of commonly used terms in bioinformatics, genomics, and proteomics
is an indispensable companion for researchers, instructors, and students of all levels in molecular biology and computational biology, as well as investigators involved in genomics, clinical research, proteomics, and related fields.

Bioinformatics — читать онлайн ознакомительный отрывок

Ниже представлен текст книги, разбитый по страницам. Система сохранения места последней прочитанной страницы, позволяет с удобством читать онлайн бесплатно книгу «Bioinformatics», без необходимости каждый раз заново искать на чём Вы остановились. Поставьте закладку, и сможете в любой момент перейти на страницу, на которой закончили чтение.

Тёмная тема
Сбросить

Интервал:

Закладка:

Сделать

3 Buels, R., Yao, E., Diesh, C.M. et al. (2016). JBrowse: a dynamic web platform for genome visualization and analysis. Genome Biol. 17: 66.

4 Buniello, A., MacArthur, J.A.L., Cerezo, M. et al. (2019). The NHGRI-EBI GWAS Catalog of published genome-wide association studies, targeted arrays and summary statistics. Nucleic Acids Res. 47 (D1): D1005–D1012.

5 Camacho, C., Coulouris, G., Avagyan, V. et al. (2009). BLAST+: architecture and applications. BMC Bioinformatics 10: 421.

6 Cunningham, F., Achuthan, P., Akanni, W. et al. (2019). Ensembl 2019. Nucleic Acids Res 47 (D1): D745–D751.

7 ENCODE Project Consortium (2012). An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome. Nature 489 (7414): 57–74.

8 Frankish, A., Uszczynska, B., Ritchie, G.R. et al. (2015). Comparison of GENCODE and RefSeq gene annotation and the impact of reference geneset on variant effect prediction. BMC Genomics 16 (Suppl 8): S2.

9 Goffeau, A., Barrell, B.G., Bussey, H. et al. (1996). Life with 6000 genes. Science 274 (5287): 546, 563–567.

10 Green, E.D. (2001). Strategies for the systematic sequencing of complex genomes. Nat. Rev. Genet. 2 (8): 573–583.

11 GTEx Consortium (2015). Human genomics. The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: multitissue gene regulation in humans. Science 348 (6235): 648–660.

12 Haeussler, M., Zweig, A.S., Tyner, C. et al. (2019). The UCSC Genome Browser database: 2019 update. Nucleic Acids Res 47 (D1): D853–D858.

13 Harrow, J., Frankish, A., Gonzalez, J.M. et al. (2012). GENCODE: the reference human genome annotation for The ENCODE Project. Genome Res. 22 (9): 1760–1774.

14 Herrero, J., Muffato, M., Beal, K. et al. (2016). Ensembl comparative genomics resources. Database (Oxford) 2016: bav096.

15 Howald, C., Tanzer, A., Chrast, J. et al. (2012). Combining RT-PCR-seq and RNA-seq to catalog all genic elements encoded in the human genome. Genome Res. 22 (9): 1698–1710.

16 Hubbard, T., Barker, D., Birney, E. et al. (2002). The Ensembl genome database project. Nucleic Acids Res. 30 (1): 38–41.

17 Kent, W.J. (2002). BLAT–the BLAST-like alignment tool. Genome Res. 12 (4): 656–664.

18 Kent, W.J. and Haussler, D. (2001). Assembly of the working draft of the human genome with GigAssembler. Genome Res. 11 (9): 1541–1548.

19 Kent, W.J. and Zahler, A.M. (2000). The intronerator: exploring introns and alternative splicing in Caenorhabditis elegans. Nucleic Acids Res. 28 (1): 91–93.

20 Kinsella, R.J., Kähäri, A., Haider, S. et al. (2011). Ensembl BioMarts: a hub for data retrieval across taxonomic space. Database (Oxford) 2011: bar030.

21 Kitts, P. (2003). Genome assembly and annotation process. In: The NCBI Handbook (eds. J. McEntyre and J. Ostell) ch. 14. Bethesda, MD: National Center for Biotechnology Information.

22 Lander, E.S., Linton, L.M., Birren, B. et al., and International Human Genome Sequencing Consortium (2001). Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature 409 (6822): 860–921.

23 Lawrence, M., Daujat, S., and Schneider, R. (2016). Lateral thinking: how histone modifications regulate gene expression. Trends Genet. 32 (1): 42–56.

24 Li, R., Fan, W., Tian, G. et al. (2010). The sequence and de novo assembly of the giant panda genome. Nature 463 (7279): 311–317.

25 McLaren, W., Gil, L., Hunt, S.E. et al. (2016). The Ensembl variant effect predictor. Genome Biol. 17 (1): 122.

26 Moreland, R.T., Nguyen, A.D., Ryan, J.F. et al. (2014). A customized Web portal for the genome of the ctenophore Mnemiopsis leidyi. BMC Genomics 15: 316.

27 Mudge, J.M. and Harrow, J. (2015). Creating reference gene annotation for the mouse C57BL6/J genome assembly. Mamm. Genome 26 (9–10): 366–378.

28 Ryan, J.F., Pang, K., Schnitzler, C.E. et al. (2013). The genome of the ctenophore Mnemiopsis leidyi and its implications for cell type evolution. Science 342 (6164): 1242592.

29 Sayers, E.W., Agarwala, R., Bolton, E.E. et al. (2019). Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Res 47 (D1): D23–D28.

30 Skinner, M.E. and Holmes, I.H. (2010). Setting up the JBrowse genome browser. Curr. Protoc. Bioinformatics. Chapter 9: Unit 9.13. https://doi.org/10.1002/0471250953.bi0913s32.

31 Trapnell, C., Williams, B.A., Pertea, G. et al. (2010). Transcript assembly and quantification by RNA-Seq reveals unannotated transcripts and isoform switching during cell differentiation. Nat. Biotechnol. 28 (5): 511–515.

32 Wheeler, D.L., Church, D.M., Lash, A.E. et al. (2001). Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Res. 29 (1): 11–16.

33 Wolfsberg, T.G., Wetterstrand, K.A., Guyer, M.S. et al. (2002). A user's guide to the human genome. Nat. Genet. 32 (Suppl): 1–79.

34 Wu, P.Y., Phan, J.H., and Wang, M.D. (2013). Assessing the impact of human genome annotation choice on RNA-seq expression estimates. BMC Bioinformatics 14 (Suppl 11): S8.

35 Zerbino, D.R., Johnson, N., Juetteman, T. et al. (2016). Ensembl regulation resources. Database (Oxford) 2016, pii: bav119.

This chapter was written by Dr. Tyra G. Wolfsberg in her private capacity. No official support or endorsement by the National Institutes of Health or the United States Department of Health and Human Services is intended or should be inferred .

Конец ознакомительного фрагмента.

Текст предоставлен ООО «ЛитРес».

Прочитайте эту книгу целиком, на ЛитРес.

Безопасно оплатить книгу можно банковской картой Visa, MasterCard, Maestro, со счета мобильного телефона, с платежного терминала, в салоне МТС или Связной, через PayPal, WebMoney, Яндекс.Деньги, QIWI Кошелек, бонусными картами или другим удобным Вам способом.

Тёмная тема
Сбросить

Интервал:

Закладка:

Сделать

Похожие книги на «Bioinformatics»

Представляем Вашему вниманию похожие книги на «Bioinformatics» списком для выбора. Мы отобрали схожую по названию и смыслу литературу в надежде предоставить читателям больше вариантов отыскать новые, интересные, ещё непрочитанные произведения.


Bioinformatics and Medical Applications
Неизвестный Автор
Computation in BioInformatics
Неизвестный Автор
Data Analytics in Bioinformatics
Неизвестный Автор
Отзывы о книге «Bioinformatics»

Обсуждение, отзывы о книге «Bioinformatics» и просто собственные мнения читателей. Оставьте ваши комментарии, напишите, что Вы думаете о произведении, его смысле или главных героях. Укажите что конкретно понравилось, а что нет, и почему Вы так считаете.

x