John Abrams - Coronavirus ( L'assassí invisible)

Un estudi metagenòmic publicat en 2019 va revelar prèviament que el SARS-COV, la soca del virus que provoca el SARS, va ser el coronavirus més àmpliament distribuït entre una mostra de pangolinsde la sonda. [50]el 7 de febrer de 2020, es va anunciar que els investigadors de Guangzhou havien descobert una Mostra de pangolí amb una seqüència d'àcids nucleics virals "99% idèntiques" a SARS-COV-2. [51]quan es va alliberar, els resultats van aclarir que "el domini d'Unió de receptors de la proteïna S del recentment descobert pangolin-COV és pràcticament idèntic al de 2019-ncov, amb una diferència d' aminoàcid ." [52]els pangolins estan protegits per la Llei xinesa, però la seva caça furtiva i el seu ús en la medicina tradicional xinesa segueix sent comuna. [53] [54]

Els microbiòlegs i genetistes de Texas han trobat de forma independent evidència de reassortiment en els coronavirus que suggereixen la implicació dels PANGOLINS en l'origen del SARS-COV-2. [55]no obstant això, els coronavirus de pangolí només es van trobar amb la data en la majoria del 92% dels seus genomes SENCERS amb el SARS-COV-2, fent-los menys similars que RaTG13 al SARS-COV-2. [56]això no és suficient per demostrar que pangolins sigui l'amfitrió intermedi; en comparació, el virus del SARS encarregat del brot de l'any 2002 – 2004 compartia el 99,8% del seu genoma amb un conegut coronavirus de la Civeta .

ELS RATPENATS DE FERRADURA es troben entre els embassaments naturals més probables del SARS-COV-2 .

Filogènia i taxonomia

SARS-CoV-2 pertany a l'àmplia família de virus coneguts com coronavirus. És un virus d' ARN monocatenat (+ssrna) de sentit positiu. Altres coronavirus són capaços de causar malalties que van des del refredat comú a malalties més severes com la Síndrome respiratòria de l'Orient Mitjà (MERS). És el setè conegut coronavirus per infectar a la gent, després de 229e, NL63, OC43, HKU1, MERS-COV, i l'original SARS-COV. [57]

Com la soca de coronavirus relacionada amb el Sars, implicada en el brot del SARS 2003, SARS-COV-2 és membre del subgènere sarbecovirus (beta-COV llinatge B). [58] [59]la seva seqüència d' arn és d'aproximadament 30.000 bases de longitud. El SARS-CoV-2 és únic entre els betacoronavirus coneguts en la seva incorporació d'un jaciment de cleavatge polybasic, una característica coneguda per incrementar la patogenicitat i la transmissibilitat en altres virus. [60] [61]

Amb un nombre suficient de genomesseqüenciats, és possible reconstruir un arbre filogenètic de la història de la mutació d'una família de virus. El 12 de gener de 2020, cinc genomes del SARS-CoV-2 havien estat aïllats de Wuhan i reportats pel centre xinès per al control i la prevenció de malalties (ccdc) i altres institucions; [62]el nombre de genomes va augmentar a 42 el 30 de gener de 2020. [63]una anàlisi filogenètic d'aquestes mostres va mostrar que estaven "altament relacionats amb la majoria de set mutacions relatives a un avantpassat comú", el que implica que la primera infecció humana es va produir al novembre o desembre de 2019. [63]a partir del 27 de març de 2020, 1.495 SARS-COV-2 genomes mostrejats en sis continents van ser públicament disponibles. [64]

L' 11 de febrer de 2020, el Comitè Internacional de taxonomia de virus (ICTV) va anunciar que d'acord amb les regles existents que calculaven les relacions jeràrquiques entre els coronavirus sobre la base de cinc seqüències d ' àcids nucleics, les diferències entre el que llavors s'anomenava 2019-NCOV i la soca del virus del brot del SARS 2003 eren viral species Per tant, van identificar 2019-nCoV com una varietat de coronavirus de la Síndrome respiratòria aguda greu. [2]

BIOLOGIA ESTRUCTURAL

Cadascun dels SARS-COV-2 virió és aproximadament de 50 – 200 nanòmetres de diàmetre. Com altres coronavirus, SARS-COV-2 té quatre proteïnes estructurals, conegudes com les proteïnes s (Spike), E (sobre), M (membrana) i N (nucleocàpside); la proteïna N conté el genoma de l'ARN, i les proteïnes S, E i M creen l' embolcall viral. [65]la proteïna Spike, que ha estat fotografiada a nivell atòmic utilitzant microscopia electrònica criogènica, [66] [67]és la proteïna encarregada de permetre que el virus s'adjunti i es fusionen amb la membrana d'una cèl·lula hoste.

––––––––

ESTRUCTURA DEL SARSR-COV virió

––––––––

EL SARS-COV-2 SPIKE homotrímer amb una subunitat de proteïna ressaltada; el domini d'Unió ACE2 és a Magenta

Els experiments de modelatge de proteïnes sobre la proteïna d'espiga del virus aviat van suggerir que el SARS-CoV-2 té l'afinitat suficient per l' enzim de conversió angiotensina 2 (ACE2) en cèl·lules humanes per utilitzar-los com a mecanisme d' entrada cel·lular. [68]el 22 de gener de 2020, un grup a la Xina que treballava amb el genoma del virus complet i un grup als Estats Units utilitzant mètodes de genètica inversa de forma independent i experimentalment demostrava que ACE2 podria actuar com a receptor del SARS-COV-2. [69] [70] [71]els estudis han MOSTRAT que el SARS-COV-2 té una major afinitat amb l'ACE2 humà que la soca original del virus SARS. [66] [72]SARS-COV-2 també pot utilitzar basigin per ajudar a l'entrada de la cel·la. [73]

Micrografies electròniques amb intercalat en electrons -COV-2 (grogues) sorgides de les cèl·lules humanes cultivades en un laboratori

LA PROTEÏNA D'ESPIGA inicial imprimació per proteasa transmembrana, Serina 2 (TMPRSS2) és essencial per a l'entrada de SARS-COV-2. Després que un virió de SARS-COV-2 s'adhereix a una cèl·lula de destinació, els talls de proteasa TMPRSS2 de la cèl·lula obren la proteïna d'espiga del virus, exposant un pèptid de fusió. El virió llavors allibera ARN a la cèl·lula, obligant a la cèl·lula a produir còpies del virus que són disseminats per infectar més cèl·lules. [74] [el millor origen necessari ]SARS-COV-2 produeix almenys tres factors de virulència que promouen el vessament de nous virions de les cèl·lules hoste i inhibeixen la resposta immunitària. [65]

Epidemiologia

––––––––

BASANT-SE EN LA BAIXA variabilitat que s'exposa entre les anomenades seqüències genòmiques de SARS-COV-2 , la soca es considera detectada per les autoritats sanitàries en el termini de setmanes de la seva aparició entre la població humana a finals del 2019. El primer cas d'infecció coneguda actualment es creu que s'ha trobat el 17 de novembre de 2019. [76]posteriorment, el virus es va estendre a totes les províncies de la Xina i a més de 150 altres països d'Àsia, Europa, Amèrica del Nord, Amèrica del Sud, Àfrica i Oceania. [77]la transmissió humana a l'humana del virus s'ha confirmat en totes aquestes regions. [78]el 30 de gener de 2020, el SARS-COV-2 va ser designat una emergència sanitària pública de preocupació internacional per l'OMS, [9] [79]i l' 11 de març de 2020 l'OMS va declarar una pandèmia. [80]