John Abrams - Coronavirus Näkymätön Killer

HEVOSENKENGÄN LEPAKOT ovat yksi todennäköisimmin luonnon altaat SARS-CoV-2

Fylogenetiikka ja taksonomia

SARS-CoV-2 kuuluu laajaan virusperheeseen, jota kutsutaan coronaviruksiksi. Se on positiivinen aistiyksisäikeinen RNA (+ssRNA)-virus. Muut coronavirukset voivat aiheuttaa sairauksia, jotka vaihtelevat flunssasta common cold vakavampiin sairauksiin, kuten Lähi-idän hengitystieoireyhtymään (MERS). Se on seitsemäs tunnettu coronavirus tartuttaa ihmisiä, kun 229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV, jaalkuperäinen SARS-CoVCoV. Mitä sinä teet?

Sars-CoV-2 on sarbecoviruksen (beeta-CoV-linjan B)jäsen sarbecoviruksen (beeta-CoV-linjan B) jäsen, kuten sars-kanta. [58][59]Sen RNA-sekvenssi on noin 30 000 pohjan RNA pituinen. SARS-CoV-2 on ainutlaatuinen tunnettujen beetacoronavirusten joukossa, kun se lisää moniemäksistä pilkkoutumiskohtaa, jonka tiedetään lisäävän patogeenisuutta ja tarttuvuutta muihin viruksiin. [60][61]

Riittävän määrän sekvensoituja genomejaon mahdollista rekonstruoida virusperheen mutaatiohistorian fylogeneettinen puu. 12. tammikuuta 2020 mennessä viisi SARS-CoV-2:n genomia oli eristetty Wuhanista ja kiinantaudinehkäisy- ja -ehkäisykeskus (CCDC) ja muut laitokset ilmoittivat niistä. [62]Genomien määrä kasvoi 42:aan 30 päivään tammikuuta 2020 mennessä. [63]Näiden näytteiden fylogeneettinen analyysi osoitti, että ne olivat "hyvin sukua enintään seitsemälle mutaatiolle suhteessa yhteiseen esi-isään",mikä viittaa siihen, että ensimmäinen ihmisen infektio tapahtui marras- tai joulukuussa 2019. [63]Maaliskuun 27 päivänä 2020 lähtien 1 495 sars-CoV-2-genomia, joista näytteet otettiin kuudella mantereella, olivat julkisesti saatavilla. Mitä sinä täällä teet?

Kansainvälinen virusten taksonomiakomitea (ICTV) ilmoitti 11 päivänä helmikuuta 2020, että olemassa olevien sääntöjen mukaan, jotka muodostavat coronavirusten hierarkkiset suhteet viiden säilyneen nukleiinihapposekvenssinperusteella, erotniin kutsutun 2019-nCoV:n ja vuoden 2003 SARS-taudin puhkeamisen viruskannan välillä conserved sequences eivät riitä erottamaan niitä viruslajeista. Siksi he tunnistivat 2019-nCoV:n vakavan akuutin hengitystieoireyhtymään liittyvän coronaviruksen kantana. . Mitä sinä teet?

Wuhan-Hu-1:n genominen organisointi, sars-CoV-2:n varhaisin jaksotettu näyte
NCBI-genomin tunnus	MN908947 (mn908947)
Genomin koko	29 903 emästä
Valmistumisvuosi	2020

RAKENTEELLINEN BIOLOGIA

Jokainen SARS-CoV-2 virion on halkaisijaltaan noin 50–200 nanometriä. Kuten muillakin coronaviruilla, SARS-CoV-2: lla on neljä rakenteellista proteiinia, jotka tunnetaan nimellä S (piikki), E (kirjekuori), M (kalvo) ja N(nukleokapsid)proteiinit; N-proteiini pitää RNA-genomin ja S-, E- ja M-proteiinit yhdessä luovat viruskuoren viral envelope. [65]Piikkiproteiini, joka on kuvannut atomitasolla kryogeenisen elektronimikroskopialla, [66][67]onproteiini,joka on vastuussa viruksen kiinnittymisen ja sulakkeen liittämisestä isäntäsolun kalvoon.

––––––––

SARSR-COV-VIRIONIN rakenne

––––––––

SARS-COV-2 PIIKKIHOMOTRIME, jossa on yksi proteiinialayksikkö korostettuna; ACE2:n sitova verkkotunnus on magenta

Proteiinimallinnuskokeet viruksen piikkiproteiinilla viittaavat pian siihen, että SARS-CoV-2:lla on riittävä affiniteetti angiotensiinikonvertaasin 2 (ACE2) reseptoriin ihmisen soluissa, jotta niitä käytettäisiin solujen sisääntulonmekanismina.. [68]22. tammikuuta 2020 mennessä ryhmä Kiinassa, joka työskentelee koko viruksen genomin kanssa, ja ryhmä Yhdysvalloissa käänteisgeenimenetelmiä käyttäen itsenäisesti ja kokeellisesti osoitti, että ACE2 voisi toimia SARS-CoV-2:n reseptorina. [69][70][71]Tutkimukset ovat osoittaneet, että SARS-CoV-2:lla on suurempi affiniteetti ihmisen ACE2:hen kuin alkuperäisellä SARS-viruskannalla. [66][72]SARS-CoV-2 voi myös käyttää basisiinia solujen syöttämiseen. Mitä sinä teet?

Laboratoriossa viljellyistä ihmissoluista peräisin olevat digitaalisesti värjätyt elektronimikrografiat SARS-CoV-2-virionista (keltainen)

ENSIMMÄINEN PIIKKI proteiini pohjustus kalvoproteaasin, serine 2 (TMPRSS2) on välttämätöntä pääsyn SARS-CoV-2. Kun SARS-CoV-2 virion kiinnittyy kohdesoluun, solun proteaasi TMPRSS2 leikkaa avata viruksen piikkiproteiinin paljastaen fuusiopeptidin. Virion sitten vapauttaa RNA soluun, pakottaa solun tuottamaan kopioita virus, joka levitetään tartuttaa enemmän soluja. [74] [parempi lähde tarvitaan ]SARS-CoV-2 tuottaa vähintään kolme virulenssitekijät, jotka edistävät irtoaminen uusien virions isäntäsolujen ja estää immuunivastetta. Mitä sinä teet?

Epidemiologian

––––––––

TUNNETTUJEN SARS-COV-2-genomisekvenssien vähäisen vaihtelun perusteella genomic terveysviranomaisten uskotaan havainnun kannan muutaman viikon kuluessa sen ilmaantumisesta ihmispopulaatiossa vuoden 2019 lopulla. Varhaisimman tällä hetkellä tunnetun infektion katsotaan löytyneen 17.11.2019. [76]Virus levisi myöhemmin kaikkiin Kiinan maakuntiin ja yli 150 muuhun maahan Aasiassa, Euroopassa, Pohjois-Amerikassa, Etelä-Amerikassa, Afrikassa ja Oseaniassa. [77]Viruksen leviäminen ihmisestä ihmiseen on vahvistettu kaikilla näillä alueilla. [78]WHO nimesi 30 päivänä tammikuuta 2020 SARS-CoV-2:n kansainvälisen huolta aiheuttavaksi kansanterveydelliseksi hätätilaksi [9][79]ja 11 päivänä maaliskuuta 2020 WHO julisti sen pandemiaksi.. Mitä sinä täällä teet?

SARS-COV-2-VIRIONIEN (punainen) mikrografi, joka oli eristetty potilaasta kaudella 2019–20

Viruksen kappaleen valmistamisen perusnumeron (R R0)) on arvioitu olevan 1,4–3,9. Tämä tarkoittaa sitä, että jokaisen viruksen infektion odotetaan johtavan 1,4-3,9 uusiin infektioihin, kun yksikään yhteisön jäsen ei ole immuuni eikä ennaltaehkäiseviä toimenpiteitä toteuteta. Kappaleen lukumäärä voi olla suurempi tiheään asutuissa olosuhteissa , kuten risteilyaluksilla. [83]Tietyissä olosuhteissa voidaan käyttää monenlaisia ennaltaehkäiseviä toimia viruksen leviämisen vähentämiseksi.

Manner-Kiinassa on ollut noin 82 000 vahvistettua tartuntatapausta. [77]Vaikka niiden infektioiden osuus, jotka johtavat vahvistettuihin tapauksiin tai taudin diagnosoitavuuteen, on edelleen epäselvä, [84]yksi matemaattinen malli arvioi, että 25. [85] EnnenCOVID-19 Hubei province, where Wuhan is located. 24. [87][88]7.4.2020 lähtien prosenttiosuus oli laskenut 4,0 prosenttiin. Mitä sinä täällä teet?