Молекула белка образована вполне определённой последовательностью аминокислотных остатков. Эта последовательность подобрана таким образом, что в избранной конформации молекулы, резко понижается её энергия в сравнении со всеми прочими конформациями. Система внутримолекулярных взаимодействий определяется аминокислотной последовательностью молекулы. В каждой молекуле белка чередование различных звеньев-аминокислот строго упорядочено. Если имеется в виду чередование аминокислотных остатков в белковой молекуле, то речь идёт о первичной её структуре. Под вторичной структурой, определяемой экспериментально, подразумевается правая α-спираль (L-изомеры), β-складчатая структура и левая α-спираль (D-изомеры) — типы периодических структур. Рис. 1. При этом надо исходить из известного правила, диктуемого принципом неопределённости: анализ биологических структур требует моделей, которые представляют собой определённые классы эквивалентности состояний, а не сами эти состояния, поскольку левая α-спираль с D-изомерами в конкретном белке может и не встретиться. Третичная структура молекулы — её пространственное строение. Способность самопроизвольно сворачиваться в одну-единственную, строго определённую пространственную структуру (отмеченное выше взаимное наложение сторон рис.1) — одно из главнейших отличий белков от прочих полимеров.
Эрос и Танатос. Понижение и повышение энтропии
В отношении Танатоса речь пойдёт не о старости, как о результате накопления «ошибок» в силу недорепликации концов хромосом при синтезе ДНК с последующим синтезом белка по «испорченной» матрице РНК, и не о биологическом боевом оружии. При этом, естественно, налицо проявление Танатоса и в том и в другом случае. В первом случае на молекулярном уровне, во втором — на социальном. Нас будет интересовать, однако, его непосредственная связь только лишь с самой центральной догмой молекулярной биологии, гласящей «незыблемое»: ДНК → РНК → Белок. Известно, что разница в энергии исходных и конечных продуктов определяет направление химических реакций. Если процесс перехода «исходное вещество» → «продукты реакции» сопровождается понижением энергии, реакция возможна. Если нет, то — нет.
На рис.1 представлено протекание второй производной X''энергии Xактивации химических реакций по времени: совмещение в одном процессе двух рудиментарных влечений (Эроса и Танатоса). Противоположная направленность протекания X''в области локализации квазизамкнутой пространственной структуры глобулы (фазы 1—6 и 1'—6') вызвана контрвариантностью организующего вектора пространства-времени, имеющей физическую интерпретацию [2].
Этой же контрвариантностью объясняется двойная односторонняя закрученность ДНК (противоположная для направленных навстречу друг другу векторов энергетического процесса) и α-спирали вторичной структуры. Совмещение Эроса и Танатоса с победой Эроса — максимум мощности X'активации химических реакций (но не максимум энергии) — репликация (начало в точке X''= 0) — минимум энтропии. В этой точке энергия разрушения старых валентных связей равна энергии возникновения новых.
В танатально-дискретных фазах 1 (1') и 6 (6') энергия разрушения старых связей выше энергии возникновения новых (повышенная энтропия с «горячей энергией»).
Рис. 1. Интерфаза белковой глобулы (вторичная структура).
Способность ДНК к репликации (делению) необратимо утрачивается полностью 36 36 Отдалённым следствием такой утраты служит неделимость нервных клеток живых организмов и формирование у них нервной системы под действием танатальных влечений.
(победа Танатоса). В фазах 3 и 3' энергия ниже требуемой для возникновения новых ковалентных связей. Поддержание действующих связей обеспечивается минимальным уровнем активации химических реакций (повышенная энтропия с «холодной» энергией). Утрата способности ДНК к репликации в этих фазах обратима. Фазы 2, 2' — переход высокоэнтропийной энергии из «горячей» в «холодную». Универсальный энергоноситель активации (аденозинтрифосфат), «лаборатории» (митохондрии) для получения его из энергетических ресурсов клетки и последующего выхода из фаз 3, 3' у белка имеются. В фазах 4, 4' и 5, 5' — рост энергии активации соответственно с понижением и повышением энтропии. Сохранение однонаправленности центральной догмы молекулярной биологии означает рассмотрение процессов в природе только в области пониженной энтропии, игнорируя области её повышенных значений . В этой связи можно сделать некоторое обобщение, охватывающее, как частный случай, рассматриваемый вопрос, поскольку все биологические структуры диссипативны, необратимы, далеки от равновесия и связаны энергетическими потоками с окружающей средой. Любой значительный этап эволюции завершается гигантским (ранее недостижимым) ростом энтропии (фазы 1, 6), с понижением до глобального её минимума ( X''= 0 в точке перехода из фазы 4 в фазу 5) в последующей интерфазе (качественно новый уровень совершенствования системы). Психически (у человека [2]) или материально (у всех объектов живой природы) оба феномена воспроизводятся в менее выраженной форме в последующих интерфазах эволюции.
Читать дальше
Конец ознакомительного отрывка
Купить книгу