Эд Йонг - Как микробы управляют нами. Тайные властители жизни на Земле

236

Пэт Шлосс, например, написал программу, которая предсказывает по образцу микробиома, в какой степени он подвержен колонизации C-diff (Schubert et al., 2015).

237

Некоторые ученые пытались ответить на этот вопрос, наблюдая за собственными микробиомами. Эрик Альм и Лоуренс Дэвид из Массачусетского технологического института занимались этим ежедневно на протяжении года. Дэвид, подхватив так называемую диарею путешественника в Бангкоке, получил возможность проследить, как сообщество его кишечных микробов пережило переворот и со временем вернулось в нормальное состояние. Альм, подцепив сальмонеллу после неудачного похода в ресторан, заметил, как быстро эта зараза захватила весь его кишечник и как сообщество микробов переключилось в совершенно другое состояние, когда он выздоровел (David et al., 2014).

238

Subramanian et al., 2014.

239

Вместе с Плэнером этим исследованием руководил Эндрю Кау (Kau et al., 2015).

240

Chowbacca, от англ. chow – корм. – Прим. ред.

241

Redford et al., 2012.

242

История Фрица: University of Utah, 2012. Первоначальное описание HS: Clayton et al., 2012. Второй случай пока не опубликован.

243

Дерево, о которое поранился мальчик, все еще растет – в отличие от яблони Фрица. Дейл планирует к нему съездить и взять образец HS в естественной среде обитания. Тогда он сможет провести рискованный, но значимый эксперимент – ввести HS в насекомых в надежде, что получится создать новый, искусственный симбиоз.

244

Бактерии Sodalis удивительно хороши в деле подселения в клетки животных, и большую роль в этом играет чувство кворума – способность бактерий координировать действия в зависимости от их плотности и концентрации выделяемых ими сигнальных молекул. Члены научной группы Колина Дейла подселяли в долгоносиков мутантных Sodalis с нарушенным чувством кворума, и бактерии попросту убивали насекомых. Обычно же Sodalis по достижении определенной плотности отключают ряд генов, производящих летальные для хозяина белки, и затем хорошо с ним уживаются. Успех Sodalis как симбионтов в том, что они тонко чувствуют, когда нужно остановиться (Enomoto et al., 2017). – Прим. ред .

245

Дейл может их различить, потому что у разных вариантов – поселившихся, скажем, в мухах цеце и в долгоносиках – утрачены разные гены из полного набора, которым обладает HS. Они развились из похожих на HS предковых микробов, которых приручили независимо друг от друга.

246

Тли и передача микробов половым путем: Moran, Dunbar, 2006; мокрицы-каннибалы: Le Clec’h et al., 2013; белокрылки и сок растений: Caspi-Fluger et al., 2012; человек и заглатывание микробов с пищей: Lang et al., 2014; наездники как загрязненные шприцы: Gehrer, Vorburger, 2012.

247

Джон Дженайк помещал клещей, сосущих кровь одного вида плодовых мушек, на представителей другого вида. Разумеется, вскоре эти самые представители обзавелись микробами, обитавшими прежде лишь в организме мушек первого вида (Jaenike et al., 2007).

248

О зарождении новых симбиозов: Sachs et al., 2011; Walter, Ley, 2011.

249

Kaltenpoth et al., 2005.

250

Funkhouser, Bordenstein, 2013; Zilber-Rosenberg, Rosenberg, 2008.

251

Я как-то раз спросил у Фукацу, как он решает, над чем работать. Он призадумался, указал пальцем на воображаемую пылинку в воздухе и воскликнул: «Ага! Интересно!» А потом просто улыбнулся мне. Когда я задал тот же вопрос Мартину Калтенпоту, он ответил: «Я ищу вид, которым не занимается Такема, и говорю, что начал его исследовать». Статьи Такемы Фукацу о клопах: Hosokawa et al., 2008; Kaiwa et al., 2014; Hosokawa et al., 2012.

252

Pais et al., 2008.

253

Osawa et al., 1993.

254

Мягко говоря. Я опросил множество исследователей микробиома на тему того, к каким результатам они относятся наиболее скептически, и многие указали именно на эти.

255

Многие животные, обитающие под водой, выпускают своих симбионтов прямо в воду, чтобы у их личинок и детенышей их было достаточно. Гавайская эупримна, например, это делает каждое утро, на рассвете. Медицинская пиявка каждые несколько дней выделяет из кишечника слизь с высоким содержанием микробов, и ее привлекает слизь, выделенная другими пиявками (Ott et al., 2015). Некоторые виды круглых червей убивают насекомых, изрыгая в их кровеносную систему кучу ядовитых бактерий. Их личинки развиваются внутри мертвых насекомых и на определенном этапе пожирают симбионтов-убийц – они им еще пригодятся (Herbert, Goodrich-Blair, 2007).