Карин Мёллинг - Вирусы - Скорее друзья, чем враги

Цвет – помогает «увидеть» эффекты мутации, эпи- и парамутации у кукурузы, мышей агути и мышей с белыми хвостами, полоски на тюльпанах, растения в крапинку, полоску и с кольцевой пятнистостью, в веретеновидности клубней картофеля, а также окраске зебр, леопардов и, я полагаю, также декоративных карпов кои. Характер распределения окраски обусловлен взаимовлиянием главным образом двух основных типов клеток, химических соединений, или «морфогенов», активатора и ингибитора; при этом имеют значение такие факторы, как геометрия и частота. В 1952 г. знаменитый английский математик Алан Тьюринг описал это явление при помощи двух дифференциальных уравнений. «Механизм Тьюринга» относится к системе активации–диффузии или к системе «активатор–ингибитор». Вероятно, в ряде случаев в роли активатора выступает вирус, а ингибитора – сайленсерная siРНК, обусловливающая появление белых пятен на петуниях.

Центральная догма – поток информации внутри клетки, по определению Ф. Крика, «от ДНК к РНК и к белкам»; передача информации от ДНК к РНК называется транскрипцией. Важная роль, которую РНК играет в качестве биомолекулы, дает основание предположить, что в процессе эволюции сначала сформировался механизм движения информации в обратном направлении: от РНК к белкам и от РНК к ДНК, тогда так называемая «обратная» транскрипция действительно является реальной (оригинальной).

ЭБВ (вирус Эпштейна–Барр) – вирус герпеса, вызывающий три заболевания: мононуклеоз – доброкачественную ангину («болезнь поцелуев») в странах Запада, лимфому Буркитта (ЛБ) в Африке и назофарингеальную саркому в Китае в зависимости от последовательности вируса и кофакторов.

ЭК – элитный контроллер; люди, обладающие естественной резистентностью к ВИЧ-нагрузке или способностью ее контролировать.

Экзон – в эукариотических генах экзоны составляют белок-кодирующую последовательность, прерываемую интронами, которые не кодируют белки. Вирусные и большинство прокариотических генов состоят только из экзонов.

Экспедиция Tara Oceans – морская экспедиция, проводившаяся Европейской организацией по молекулярной биологии (EMBO) с 2009 по 2013 г. во всех океанах, во время которой было собрано 35 000 образцов планктона с 200 станций; описано 40 млн генов, по большей части неизвестных; в верхних слоях океана обнаружено 5000 популяций вируса, см. Science, май 2015 г.

Эндогенный (ретро)вирус – (ретро)вирус в геноме, происходящий из вирусных инфекций зародышевых клеток. Такие вирусы, как правило, не формируют частицы и «вертикально» передаются следующим поколениям. Процесс эндогенизации может наблюдаться в реальном времени в популяции австралийских коал.

Эпигенетика – временные изменения ДНК/хроматина, не сопровождающиеся мутацией; генетическая информация, не подчиняющаяся законам Менделя, химическая модификация, являющаяся результатом присоединения метиловых групп к ДНК (в основном на CpG-сайтах) или ацетилирования белков-гистонов, вызванного активностью регуляторной ДНК и активацией РНК-зависимых ДНК-метилтрансфераз, метиляторов, что часто обусловливает инактивацию промоторов. Такая информация, как правило, не передается по наследству; цвет как видимый индикатор эпигенетических изменений был впервые выявлен у кукурузы. Эпигенетические изменения могут привести к развитию рака, поэтому требуются новые диагностические методы, в частности бисульфитная конверсия, которая предусматривает превращение неметилированных С в геноме в Т, что выявляется при секвенировании.

Эпигенетические изменения – негенетическая модификация ДНК/хроматина, которая возникает в результате мутации, не подчиняющейся законам Менделя, и обусловлена факторами среды (речь идет о присоединении метиловых групп к нуклеотидам ДНК или модификациях ДНК-ассоциированных белков путем ацетилирования), равно как и прочими факторами; а также упаковка ДНК, нормальная для одного поколения, обусловленная средовыми факторами; эти изменения исчезают при оплодотворении, но в ряде случаев также могут передаваться двум последующим поколениям через зародышевые клетки, главным образом в силу стресса, возникающего во время беременности, в частности голода.

ЭС-клетки (ES) – эмбриональные стволовые клетки, которые под действием биомолекулярных стимуляторов могут развиться в одну из 200 специфических (дифференцированных) клеток организма человека. Во многих случаях их запрещено использовать в исследовательских целях. При комбинаторном использовании четырех факторов транскрипции можно вернуть дифференцированные взрослые клетки в эмбриональное состояние (см. iPS-клетки).