Сергей Ястребов - От атомов к древу. Введение в современную науку о жизни

Atkins M. S., McArthur A. G., Teske A. P. Ancyromonadida: a new phylogenetic lineage among the protozoa closely related to the common ancestor of metazoans, fungi, and choanoflagellates (Opisthokonta) // Journal of Molecular Evolution , 2000, V. 51, № 3, 278–285.

Carter H. J. XXXII. — On the fresh-and salt-water Rhizopoda of England and India // Journal of Natural History , 1865, V. 15, № 88, 277–293.

Brugerolle G. et al. Collodictyon triciliatum and Diphylleia rotans (= Aulacomonas submarina) form a new family of flagellates (Collodictyonidae) with tubular mitochondrial cristae that is phylogenetically distant from other flagellate groups // Protist , 2002, V. 153, № 1, 59–70.

Zhao S. et al. Collodictyon — an ancient lineage in the tree of eukaryotes // Molecular Biology and Evolution , 2012, V. 29, № 6, 1557–1568.

Brown et al. , 2013.

Burki , 2014.

Cavalier-Smith T. et al. Multigene phylogeny resolves deep branching of Amoebozoa // Molecular Phylogenetics and Evolution , 2015, V. 83, 293–304.

Burki , 2014.

Голиченков В. А., Никерясова Е. Н., Попов Д. В. Значение массы клеток для становления и эволюции онтогенеза // Современная эволюционная морфология. — Киев: Наукова думка, 1991. С. 130–139.

Corliss J. O. The kingdom Protista and its 45 phyla // BioSystems , 1984, V. 17, № 2, 87–126.

Corliss J. O. Protistan diversity and origins of multicellular / multitissued organisms // Italian Journal of Zoology , 1989, V. 56, № 3, 227–234.

Dickinson D. J., Nelson W. J., Weis W. I. An epithelial tissue in Dictyostelium challenges the traditional origin of metazoan multicellularity // BioEssays , 2012, V. 34, № 10, 833–840.

Dickinson D. J., Nelson W. J., Weis W. I. Studying epithelial morphogenesis in Dictyostelium // Tissue morphogenesis: methods and protocols. Springer New York, 2015. 267–281.

Miller P. W. et al. The evolutionary origin of epithelial cell-cell adhesion mechanisms // Current Topics in Membranes , 2013, V. 72, 267–311.

Worley A. C., Raper K. B., Hohl M. Fonticula alba: a new cellular slime mold (Acrasiomycetes) // Mycologia , 1979, V. 71, № 4, 746–760.

Deasey M. C. Spore formation by the cellular slime mold Fonticula alba // Mycologia , 1982, V. 74, № 4, 607–613.

Brown M. W., Spiegel F. W., Silberman J. D. Phylogeny of the «forgotten» cellular slime mold, Fonticula alba, reveals a key evolutionary branch within Opisthokonta // Molecular Biology and Evolution , 2009, V. 26, № 12, 2699–2709.

Paps , Ruiz-Trillo, 2010.

Brown M. W. et al. Aggregative multicellularity evolved independently in the eukaryotic supergroup Rhizaria // Current Biology , 2012, V. 22, № 12, 1123–1127.

Mikhailov et al. , 2009.

Беклемишев К. В. Зоология беспозвоночных. Курс лекций. — М.: Издательство МГУ, 1979.

Kirschner M., Gerhart J. Evolvability // Proceedings of the National Academy of Sciences , 1998, V. 95, № 15, 8420–8427.

Rupke N. A. Richard Owen’s vertebrate archetype // Isis , 1993, V. 84, № 2, 231–251.

Список может показаться произвольным, но это совершенно неизбежная особенность выбранного подхода. Произвольной (в той или иной степени) будет любая попытка выделить счетное число пороговых событий в истории жизни на целой планете. Хотя, разумеется, каждый сделанный тут выбор имеет свое объяснение: например, появление эукариот не вошло в список, потому что его можно включить в тему кислородной революции, а появление первых многоклеточных животных — потому что его гораздо труднее датировать, чем кембрийский взрыв.

De Duve C. Constraints on the origin and evolution of life // Proceedings of the American Philosophical Society , 1998, V. 142, № 4, 525–532.

Fedo C. M., Whitehouse M. J. Metasomatic origin of quartz-pyroxene rock, Akilia, Greenland, and implications for Earth’s Earliest Life // Science , 2002, V. 296, № 5572, 1448–1452.

Nutman A. P. et al. Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures // Nature, 2016, V. 537, 535–538.

Bell E. A. et al. Potentially biogenic carbon preserved in a 4.1 billion-year-old zircon // Proceedings of the National Academy of Sciences , 2015, V. 112, № 47, 14518–14521.

Harrison T. M., Bell E. A., Boehnke P. Hadean zircon petrochronology // Reviews in Mineralogy and Geochemistry , 2017, V. 83, № 1, 329–363.

Woese C. R. On the evolution of cells // Proceedings of the National Academy of Sciences , 2002, V. 99, № 13, 8742–8747.

Wacey D. et al. Microfossils of sulphur-metabolizing cells in 3.4-billion-year-old rocks of Western Australia // Nature Geoscience , 2011, V. 4, № 10, 698–702.

Sessions A. L. et al. The continuing puzzle of the great oxidation event // Current Biology , 2009, V. 19, № 14, R 567–R 574.

Schopf J. W. The fossil record of cyanobacteria // Ecology of cyanobacteria II. Springer Netherlands, 2012. 15–36.

Barbieri M. Code Biology. A New Science of Life. Springer, 2015.

Lyons T. W., Reinhard C. T., Planavsky N. J. The rise of oxygen in Earth’s early ocean and atmosphere // Nature , 2014, V. 506, 307–315.

Esser C. et al. A genome phylogeny for mitochondria among α-proteobacteria and a predominantly eubacterial ancestry of yeast nuclear genes // Molecular Biology and Evolution , 2004, V. 21, № 9, 1643–1660.

Кунин Е. В. Логика случая. — М.: Центрполиграф, 2014.