John Abrams - CORONAVIRUS

PERDESKOEN VLERMUISE is onder die mees waarskynlike natuurlike reservoirs van SARS-in-2

Phylogenetika en taksonomie

SARS-in-2 behoort aan die breë familie van virusse bekend as coronaviruses. Dit is 'n positiewe-sin enkel-gestrand RNA (+ssrna) virus. Ander coronaviruses in staat is om veroorsaak siektes wat wissel van die gewone verkoue tot meer ernstige siektes soos Midde-Ooste respiratoriese sindroom (MERS). Dit is die sewende bekende Corona om mense te besmet, na 229e, NL63, OC43, HKU1, MERS-in, en die oorspronklike SARS-in. [57]

Soos die SARS-verwante Corona spanning wat betrokke is in die 2003 SARS-uitbreking, is SARS-in-2 'n lid van die subgenus sarbecovirus (beta-in geslagb). [58] [59]sy RNA - reeks is ongeveer 30 000 basisse in lengte. SARS-in-2 is uniek onder bekende betakels , in sy inlywing van 'n polybasiese Cleavage-webwerf, 'n eienskap wat bekend patogenisiteit en oordraagbaarheid in ander virusse verhoog word. [60] [61]

Met 'n voldoende aantal opeenvolg genomes, is dit moontlik om 'n phylogenetiese boom van die mutasie geskiedenis van 'n familie van virusse te herkonstrueer. Teen 12 Januarie 2020 is vyf genomes van SARS-in-2 van Wuhan geïsoleer en deur die Chinese Sentrum vir siektebeheer en voorkoming (ccdc) en ander instellings gerapporteer; [62]die getal genomes het teen 30 januarie 2020 tot 42 gestyg. [63]'n phylogenetiese analise van daardie monsters het gewys dat hulle "hoogs verwant is aan die meeste sewe mutasies relatief tot 'n algemene voorouer", wat impliseer dat die eerste menslike infeksie in November of Desember 2019 plaasgevind het. [63]vanaf 27 maart 2020, 1 495 SARS-in-2 genomes is op ses kontinente beskikbaar gestel. [64]

Op 11 Februarie 2020 het die internasionale komitee oor taksonomie van virusse (ictv) aangekondig dat volgens bestaande reëls wat hiërargiese verhoudings onder coronaviruses bereken op grond van vyf behoue rye nukleolus sure, die verskille tussen wat dan 2019-nCoV genoem word en die virus- stam van die 2003 SARS-uitbreking was onvoldoende om hulle te laat skei virale spesies. Daarom, hulle geïdentifiseer 2019-nCoV as 'n stam van ernstige akute respiratoriese sindroom-verwante Corona. [2]

STRUKTURELE BIOLOGIE

Elke SARS-in-2 virion is ongeveer 50 – 200 nanometres in deursnee. Soos ander CORONAVIRUSES, SARS-in-2 het vier strukturele proteïene, bekend as die S (piek), E (koevert), M (membraan), en N (nukleocapsid) proteïene; die N proteïen hou die RNA genoom, en die s, E, en M proteïene saam skep die virale koevert. [65]die piek-proteïen, wat op die atoomvlak is met die gebruik van die lakogeniese elektronmikroskopie, [66] [67] is die proteïen wat verantwoordelik is vir die toelaat van die virus om aan te heg en te maak met die membraan van 'n gasheersel.

––––––––

STRUKTUUR VAN 'N SARSR-in virion

––––––––

SARS-IN-2 PIEK HOMOGENITRIMER met een proteïensubeenheid uitgelig; die ACE2 bindende domein is in magenta

Proteïenmodellering eksperimente op die piek proteïen van die virus het gou voorgestel dat SARS-in-2 voldoende affiniteit vir die reseptor angiotensien omskakeling ensiem 2 (ACE2) op menslike selle om dit te gebruik as 'n meganisme van sel inskrywing. [68]teen 22 Januarie 2020, 'n groep in China wat met die volle virus-genoom en 'n groep in die Verenigde State werk deur reverse genetika metodes onafhanklik te gebruik en eksperimenteel het GETOON dat ACE2 as die reseptor vir SARS-in-2 kan optree. [69] [70] [71]studies het getoon dat SARS-in-2 'n hoër AFFINITEIT vir menslike ACE2 het as die oorspronklike SARS virus-stam. [66] [72]SARS-in-2 kan ook basigin gebruik om te help met selinskrywing. [73]

Digitaal Kleurlinge se ELEKTRONMIKROGRAFIEKE van SARS-in-2-virions (geel) wat uit menslike selle cultured in 'n laboratorium gekweek word

AANVANKLIKE PIEK PROTEÏEN priming deur transmembraan protease, serine 2 (TMPRSS2) is noodsaaklik vir die inskrywing van SARS-in-2. Nadat 'n SARS-in-2 virion aan 'n teikensel heg, is die sel se protease TMPRSS2 besnoeiinge oop die piek proteïen van die virus, wat 'n fusion Peptiedblootlê. Die virion stel dan RNA in die sel op, dwing die sel om kopieë van die virus te produseer wat versprei word om meer selle te besmet. [74] [ beter bron nodig ]SARS-in-2 produseer ten minste drie virulensie faktore wat die vergieting van nuwe virions uit gasheerselle bevorder en immuunresponsinhibeer. [65]

Epidemiologie

––––––––

OP GROND VAN DIE LAE variasie uitgestal onder bekend SARS-in-2 genomiese rye, is die stam vermoedelik deur gesondheidsowerhede binne weke van sy opkoms onder die menslike bevolking in die laat 2019 opgespoor. Die vroegste gevalle van infeksie wat tans bekend is, is vermoedelik op 17 November 2019 gevind. [76]die virus het daarna versprei na alle provinsies van China en na meer as 150 ander lande in Asië, Europa, Noord-Amerika, Suid-Amerika, Afrika en Oseanië. [77]mens-tot-menslike oordrag van die virus is in al hierdie streke bevestig. [78]op 30 Januarie 2020 is SARS-in-2 aangewys as 'n openbare GESONDHEIDSNOODTOESTAND van internasionale kommer deur die WGO, [9] [79]en op 11 Maart 2020 die wat dit 'n pandemieverklaar het. [80]

MICROGRAAF VAN SARS-in-2 virions (rooi) geïsoleerd van 'n pasiënt gedurende die 2019-20 Corona pandemie

Die basiese reproduksie getal ( R0) van die virus is na raming tussen 1,4 en 3,9. Dit beteken dat elke infeksie van die virus verwag word om te lei tot 1,4 tot 3,9 nuwe infeksies wanneer geen lede van die gemeenskap immuun is en geen voorkomende maatreëls geneem word nie. Die reproduksie getal kan hoër in digbevolkte toestande soos dié wat op Cruise skepe. [83]baie vorme van voorkomende pogings kan in spesifieke omstandighede gebruik word om die voortplanting van die virus te verminder.

Daar was ongeveer 82 000 bevestigde gevalle van infeksie in die vasteland van China. [77]terwyl die verhouding van infeksies wat tot bevestigde gevalle of vordering tot diagnoseerbare siekte lei, steeds onduidelik is, is [84]een wiskundige model beraam dat op 25 Januarie 75 815 mense in Wuhan alleen besmet is, op 'n tyd toe die aantal bevestigde gevalle wêreldwyd net 2 015 was. [85] [86]voor 24 Februarie, oor 95% van alle sterftes van covid-19 wêreldwyd plaasgevind het in Hubei Provinsie, waar Wuhan is geleë. [87] [88]vanaf 7 April 2020 het die persentasie tot 4,0% afgeneem. [77]

Vanaf 7 April 2020 is daar 1 407 123 totale bevestigde gevalle van SARS-in-2-infeksie in die deurlopende pandemie. [77]die totale aantal sterftes wat aan die virus toegeskryf word, is 81 103. [77]daar is 298 352 mense wat van bevestigde infeksies herstel het, wat beteken dat daar 1 027 668 aktiewe gevalle is. [77]

Deel drie

Corona 2019-2020

Corona Disease 2019 (covid-19) is 'n aansteeklike siekte wat veroorsaak word deur ernstige akute respiratoriese sindroom Corona 2 (SARS-in-2). Die siekte is vir die eerste keer geïdentifiseer in Desember 2019 in Wuhan, die hoofstad van China se Hubei Provinsie, en het sedertdien wêreldwyd versprei, wat lei tot die deurlopende 2019-20 Corona pandemie. Algemene simptome sluit in koors, hoes en kortasem. Ander simptome kan insluit moegheid, spierpyn, diarree, seer keel, verlies van reuk en abdominale pyn. Terwyl die meerderheid van die gevalle lei tot milde simptome, 'n bietjie vordering na virale longontsteking en multi-orrel mislukking. Vanaf 7 April 2020 is meer as 1,41 miljoengevalle in meer as 200 lande en gebiede aangemeld , wat tot meer as 81 100 sterfteslei. Meer as 298 000 mense het herstel. [5]