Шон Кэрролл: Приспособиться и выжить!

Построение эволюционного древа гоминидов на основании элементов SINE описано в работе A.-H. Salem et al., Proceedings of the National Academy of Sciences. USA 100 (2003): 12 787–12791.

Классическая работа о роли удвоения генов в эволюции:

S. Ohno, Evolution by Gene Duplication, Berlin and New York: Springer-Verlag, 1970. Можно назвать еще несколько новых работ: M. Lynch and V. Katju, Trends in Genetics 20 (2004): 544–549; J. A. Cotton and R. D. M. Page, Proceedings of the Royal Society B 272 (2005): 277–283; и M. Lynch and]. S. Conery, Science 290 (2000): 1151–1155.

О цветовом зрении у позвоночных написано много. Для общего ознакомления с молекулярной эволюцией опсинов я рекомендую обзор S. Yokoyama, Gene 300 (2002): 69–78. Кроме того, я воспользовался данными, представленными в следующих работах: S. Yokoyama and F. B. Radlwimmer, Genetics 158 (2001): 1697–1710;). J. I. Fasick and P. R. Robinson, Visual Neuroscience 17 (2000): 781–788; J. I. Fasick and P. R. Robinson, Biochemistry 37 (1998): 433–438; S. Yokoyama and N. Taken aka, Molecular Biology and Evolution 21(2004): 2071–2078 и A.]. Hope et al., Proceedings of Biological Science 22 (1997): 155–163. Об общности между коровами и другими жвачными животными и китообразными рассказывается в статьях M. Nikaido, A. P. Rooney, and N. Okada, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 96 (1999): 10 261–10266; и M. Nikaido et al., Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 98 (2001): 7384–7389.

О настройке опсинов на восприятие ультрафиолетового света говорится в статьях Y. Shi and S. Yokoyama, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 100 (2003): 8308–8313; S. Yokoyama, F. B. Radlwimmer and N. S. Blow, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 97 (2000): 7366–7371; Y. Shi, F. B. Radlwimmer and S. Yokoyama, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 98 (2001): 11 731–11736; и A. Odeen and O. Hastad, Molecular Biology and Evolution 20 (2003): 855–861.

Статьи о значении восприятия ультрафиолетового света: у зебровой амадины — A. T. D. Bennett et al., Nature 380 (1996): 433–435; у скворцов — A. T. D. Bennett et al., Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 94 (1997): 8618–8621; у лазоревки — S. Hunt et al., Proceedings of the Royal Society of London B Biological Science 265 (1998): 451–455; у волнистого попугайчика — S. M. Pearn et al., Proceedings of the Royal Society of London B Biological Science 268 (2000); 2273–2279; у птенцов — V. Jaurdie et al., Nature 431 (2004): 262–263; у различных птиц — R. Dalton, Nature 428 (2004): 596–597. 06 оперении, отражающем ультрафиолетовый свет, рассказывается в работе F. Hausmann et al., Proceedings of the Royal Society of London B Biological Sciences 270 (2003): 61–67; о видах-двойниках — в статье R. Bleiweiss, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 101 (2004): 16 561–16564. О значении восприятия ультрафиолетового света для пустельги написано в статье J. Vlitala et al., Nature 373 (1995): 425–427, а для летучей мыши — в работе Y. Winter,]. Lopez and O. Van Helverson, Nature 425 (2003): 612–614.

Об эволюции панкреатической рибонуклеазы у колобуса сказано в статье J. Zhang, Y.-P. Zhang and H. F. Rosenberg, Nature (Genetics) 30 (2002): 411–415.

Открытие латимерии и ее изучение описано в книгах K. S. Thomson, Living Fossil: The Story of the Coelacanth, New York: W. W. Norton, 1991 и S. Weinberg, A Fish Caught in Time: The Search for the Coelacanth, New York: Harper Collins, 2000.

О том, как ген SWS-опсина латимерии стал ископаемым, рассказывается в статье S. Yokoyama et al., Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 96 (1999): 6279–6284. Об образовании ископаемых генов коротковолнового опсина у афалины можно прочесть в статье). J. I. Fasick et al., Visual Neuroscience 15 (1998): 643–651, а у других дельфинов и у китов — в работе D. H. Levenson and A. Dizon, Proceedings of the Royal Society of London B Biological Science 270 (2003): 673–679.

Образование ископаемых генов SWS-опсинов у ночных обезьян и галаго описано в работе G. H. Jacobs, M. Neitz and J. Neitz, Proceedings of the Royal Society of London B Biological Science 263 (1996): 705–710; у лори — в статье S. Kawamura and N. Kubotera, Journal of Molecular Evolution 58 (2004): 314–321; у слепого крота — в статье Z. K. David-Gray et al., European Journal of Neuroscience 16 (2002): 1186–1194.

О множестве генов обонятельных рецепторов у мыши говорится в статье X. Zhang et al., Genomics 83 (2004): 802–811. О превращении человеческих генов обонятельных рецепторов в ископаемые гены можно прочесть в работах Y. Nimura and M. Nei, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 100 (2003): 12 235–12240; B. Malnic, P. A. Godfrey and L. R. Buck, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 101 (2004): 2584–2589; и Y. Gilad et al., Public Library of Science Biology 2 (2004): 120–125. Образование ископаемого гена, связанного с восприятием феромонов, описано в работе E. R. Liman and H. Inan, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 100 (2003): 3328–3332.

Исчезновение пути утилизации галактозы у дрожжей описано в работе C. T. Hittinger, A. Rokas and S. B. Carroll, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, 101 (2004): 14 144–14149. Массовое разрушение генов у бактерии, вызывающей проказу, описано в статье S. T. Cole et al., Nature 409 (2001): 1007–1011.

Разрушение генов, ответственных за окраску цветков ипомеи, было продемонстрировано в работе R. A. Zufall and M. D. Rausher, Nature 428 (2004): 847–850. О разрушении человеческого гена MYH16 рассказывается в статье H. Stedman et al., Nature 428 (2004): 415–418; а также G. H. Perry, B. C. Verrelli and A. C. Stone, Molecular Biology and Evolution 22 (2004): 379–382.

Об открытии полного трихроматического зрения у ревунов можно узнать из статьи G. H. Jacobs et al., Nature 382 (1996): 156–158. Удвоение генов опсинов у ревунов описано в работах D. M. Hunt et al., Vision Research 38 (1998): 3299–3306; и K. S. Dulai et al.. Genome Research 9 (1999): 629–638. Обзор эволюционной истории цветового зрения у приматов: