Мартин Блейзер - Охотники за микробами. Как антибиотики, санация и дезинфекция ослабляют иммунитет и приводят к развитию новых заболеваний [litres]

9. «… не любят кислород» (см. с. 31): Микробный состав десневой борозды очень обширен; по плотности он не уступает толстой кишке, а разнообразие бактерий огромно. (I. Kroes et al., «Bacterial diversity within the human subgingival crevice,» Proceedings of the National Academy of Sciences 96 [1999]: 14547-52; and ibid.). Именно в этом пространстве между зубами и деснами развивается периодонтит, и мы надеемся, что лучше разобравшись в микробной популяции и ее динамике, мы сможем лучше предотвращать или лечить эту болезнь, часто приводящую к потере зубов.

10. «… даже привлекательность для комаров» (см. с. 31): N. О. Verhulst et al., «Composition of human skin microbiota affects attractiveness to malaria mosquitoes,» PLOS ONE 6 (2011): e28991.

11. «… сообщество из десятков видов» (см. с. 32): Z. Pei et al., «Bacterial biota in the human distal esophagus,» Proceedings of the National Academy of Sciences 101 (2004): 4250-55. До того как мы опубликовали эту статью, никто не думал, что в пищеводе могут постоянно обитать бактерии – считалось, что бактерии проходят там лишь по пути изо рта в желудок.

12. «… между типами кишечных бактерий и их функциями» (см. с. 33): Мы теперь можем с помощью новых вычислительных инструментов построить семейные древа растений и животных; то же самое мы можем сделать и для бактериальных популяций, живущих в разных экологических нишах. Мы можем сравнить состав микробных популяций пресноводных прудов и океанов. (Неудивительно, что они весьма разные.) Когда подобные инструменты применяют для изучения состава кишечных микробов, например в мышах и людях, то мы видим очень заметные параллели (R. Е. Ley et al., «Worlds within worlds: evolution of the vertebrate gut microbiota,» Nature Reviews Microbiology 6 [2008]: 776-88). На более высоких таксономических уровнях, начиная с типа, мы почти одинаковы, но, спускаясь по филогенетической лестнице, разница становится все больше, и наконец на уровне вида мыши уже сильно отличаются от людей. В каком-то смысле эти микробные сходства и различия отражают нашу эволюцию от общего предка к разным видам – Mus musculus и Homo sapiens – а также наше генетическое наследие. Да, даже обитающие в нас микробы снова напоминают нам, что «онтогенез повторяет филогенез», – эту концепцию эволюционной биологии я выучил еще в школе, задолго до того, как начал понимать, что же вообще такое эволюция.

13. «… результат деятельности микробов» (см. с. 33): W. R. Wikoffet al., «Metabolomics analysis reveals large effects of gut microflora on mammalian blood metabolites,» Proceedings of the National Academy of Sciences 106 (2009): 3698-703. Ученые сравнили безмикробных мышей (рожденных в специальных пузырях вообще без каких-либо бактерий) и обычных. Они использовали очень чувствительные химические методы сбора образцов и обнаружения, чтобы исследовать содержание крови двух групп мышей. Из почти 4200 обычных химических соединений в крови безмикробных мышей обнаружились лишь 52, чуть более 1 %; остальные 4000 – продукты бактериального метаболизма. Эти исследования доказали, что большинство химических соединений, из которых состоит кровь мышей (и, соответственно, человека), вырабатываются микробиотой и ее взаимодействием с нашими клетками.

14. «… химическая обработка и усвоение» (см. с. 34): H. J. et al., "Predicting and manipulating cardiac drug inactivation by the human gut bacterium Eggerthellalenta," Science341 (2013): 295-98.

15. «… в котором мало белка» (см. с. 34): В батате белка около 2 %, так что взрослому человеку нужно съедать около 2,5 кг батата в день, чтобы удовлетворить потребности в белке.

16. «… лактобациллы, по сути, отсутствуют» (см. с. 35): J. Ravel et al., «Vaginal microbiome of reproductive-age women,» Proceedings of the National Academy of Sciences 108, suppl. 1 (2011): 4680-87.

17. «… состав кишечного микробиома человека меняется не слишком сильно» (см. с. 37): J. Faith et al., «The long-term stability of the human gut microbiota,» Science 341 (2013): DOI: 10.1126/science.1237439. Изучая одних и тех же людей на протяжении долгого времени, лаборатория Джеффа Гордона показала, что, хотя в организме и есть определенная доля текучки, стабильность довольно значительна. Исследование обнаружило, что 70 % микроорганизмов, живших во взрослых людях, остались в них и через год при повторном анализе.

18. «… изменения микробной популяции оказались более значительными» (см. с. 37): Доктор Нанетт Стейнле из университета штата Мэриленд представила данные исследования сухих бобов и чечевицы на стендовых докладах Американского общества питания 23 апреля 2013 года. В других работах был заметен немедленный эффект диеты на микробном, но общий долгосрочный состав оставался стабильным. (См. G. Wu et al., «Linking long-term dietary patterns with gut microbial enterotypes,» Science 334 [2011]: 105-8.)

19. «… но только на время, пока люди сидели на этой диете» (см. с. 37): L. A. David et al., «Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome,» Nature (2013): DOI 10.1038/ naturel2820.