В эоценовую эпоху (58 или 55 миллионов лет назад) центральная часть Гипербореи опустилась в районе современных Гренландской, Норвежской и Лафонтенской котловин, и седимой континент был затоплен морем. Этот процесс распространился на Северную Европу и Европейскую территорию России, и большие их части тоже были залиты мелководным морским бассейном. Сушей оставались только возвышенные участки Шотландии, Норвегии, Кольского п-ова, п-ова Таймыр, других полуостровов Северной Евразии и отдельные поднятия в пределах Европы.
Гиперборея приняла очертания, отдаленно напоминающие ее контуры на карте Г. Меркатора. Приподнятые периферические части этого континента охватывали территории островов Королевы Елизаветы, Гренландии, Гренландско-Шотландского хребта, Шотландии, Скандинавии, Новой Земли, по-видимому, Карского моря, п-ова Таймыр и островов Северная Земля, Земля Франца Иосифа и Шпицберген. Внутреннее море совпадало с Гренландской, Норвежской и Лафонтенской котловинами. По всей вероятности, оно представляло собой замкнутый со всех сторон, сначала слабосоленый, а затем пресноводный водоем, о чем свидетельствуют результаты определения солености воды в эоцене и изучение остатков фауны и флоры 22. Опреснение этого моря и расположенного севернее него Арктического бассейна произошло в конце среднеэоценовой эпохи около 42 миллионов лет назад.
При таком положении Гипербореи Северный полюс должен был располагаться(в случае, если карта Р. Меркатора правильная, но составлена в современной системе координат) вблизи о. Ян-Майен или какого-то другого участка подводного хребта Мона, т.е. в районе с координатами примерно 70—75°с.ш. и 10° з.д. — 10° в.д. Это означает, что ось вращения Земли в эоценовую эпоху могла быть сдвинута приблизительно на 20° к югу от ее современного положения.
По данным, приводимым в Интернет-портале «География. Планета Земля», Южный полюс в палеогене (время не уточняется) находился около 81° ю. ш. и 94° в д.
Более южное положение Северного полюса в эоценовую эпоху хорошо согласуется с результатами изучения ископаемой флоры: растительные остатки с северных побережий Европы и Азии характерны для умеренно-теплого и субтропического климата, а те, что обнаруженны вблизи современного Северного полюса на подводном хребте Ломоносова, свойственны субтропическому и тропическому климату.
В олигоценовую эпоху (начиная с 34 миллионов лет назад) происходило дальнейшее прогибание Гренландской, Норвежской и Лафонтенской котловин, за счет чего увеличивалась глубина и площадь внутренних морей. В конце эоценовой эпохи начался спрединг между Гренландией и Западным Шпицбергеном 23и уже к раннему олигоцену (около 34 миллиона лет назад) установилась глубоководная связь между центральным Арктическим океаном (котловины Канадская, Макарова, Амудсена, Нансена) и внутренним морем Гипербореи (Гренландская котловина) в районе современного пролива Фрам. Одновременно происходило прогибание Гренландско-Шотландского хребта, начавшееся в эоцене и усилившееся в олигоценовую эпоху; в результате прежде сухопутная перемычка между Гренландией и Шотландией местами опустилась ниже уровня океана, и во внутреннее море Гипербореи также устремились воды Атлантики. Однако большая часть Гренландско-Шотландского хребта и подводного плато Ермак (о-ва Шпицберген) оставалась сушей вплоть до среднемиоценовой эпохи (примерно 15 миллионов лет назад).
Одновременно поднималась территория Сибири и пересыхало Западно-Сибирское море. В середине олигоценовой эпохи (около 30 миллионов лет назад) вся эта обширная область стала болотистой сушей, а ее наиболее приподнятая часть находилась вблизи Арктического морского бассейна на севере. Территория Европы тоже поднималась и в начале миоценовой эпохи неогенового периода (24 миллиона лет назад) полностью превратилась в сушу.
Подъем этих территорий, по-видимому, был связан с начавшимися столкновениями: Индостана — с окраиной Азии и Африки — с Северной Европой 40—20 миллионов лет назад).
Из-за перераспределения площади морей и суши, ранее принадлежащие Гиперборее территории Шотландии, Скандинавии, Кольского п-ова и других полуостровов стали входить в состав Европы, а Гиперборея сохранила за собой только острова Королевы Елизаветы, Гренландию, часть Гренландско-Шотландского хребта и, по-видимому, плато Роколл. В течение палеогенового периода (с 66 до 24 миллионов лет назад) ее площадь уменьшилась более чем в 4 раза.
Читать дальше